Posláním 26. pluku je zabezpečení nedotknutelnosti vzdušného prostoru České republiky, k jehož splnění využívá:
průzkum vzdušného prostoru
řízení letového provozu
ochranu sil (Force Protection)
Nedotknutelnost vzdušného prostoru České republiky znamená, že vzdušný prostor nad tímto územím je chráněn před neautorizovaným vstupem nebo narušením. To zahrnuje jak civilní, tak vojenské lety, a jakékoliv překročení těchto hranic bez povolení může být považováno za porušení suverenity státu. Ochrana vzdušného prostoru je důležitá pro zajištění národní bezpečnosti a obrany.
